Dans Super Bomberman R, jusqu'à deux joueurs peuvent s'entraider dans le mode "Histoire" pour venir à bout des différents niveaux et sauver la galaxie. Le principe du jeu est toujours aussi simple : guider son Bomberman au sein d'un labyrinthe en utilisant des bombes à retardement pour s'y frayer un chemin et vaincre ses adversaires dans un temps limité.
Les joueurs peuvent également s’affronter jusqu’à huit dans le mode "Bataille" ou se lancer dans le mode compétitif Grand Prix. Le mode Grand Prix voit s’affronter deux équipes, chacune composée au maximum de trois joueurs, au sein de différentes arènes en utilisant les capacités spéciales des personnages.
Les éditions PS4 et Xbox One proposent des personnages exclusifs : Jouez avec Ratchet sur PS4 et partez à l'aventure avec le Master Chief sur Xbox One.
L'édition Shiny propose des personnages exclusifs en édition limitée : 8 Bomberman Brothers Brillants et Golden Vic Viper Bomber.
